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Molgen Prokaryoten (Subject) / Rekombination (Lesson)
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- Welche Ereignisse können die Homologe Rekombination induzieren? - Doppel- und Einzelstrangbrüche, z.b. während der Replikation - radioaktive Strahlung, ROS, nach einer Transformation natürlich kompetenter Bakterien
- Welche enzymatischen Aktivitäten haben RecBD und RuvAB? Bei welchen genetischen Prozessen sind diese Enzyme/Proteine wichtig? RuvC ist eine Resolvase – welche enzymatische Aktivität hat RuvC? -Rekombination - RecB: schnelle Helicase mit Endonucleaseaktivität. 5'-3'-Richtung auf dem unteren Strang. Stimuliert RecD. - RecD: langsame Helicase mit Endonucleaseaktivität, 3'-5'-Richtung auf dem oberen Strang, daher Ausbilsdung des DNA-Loops - RecC: Bindung an DNA - RuvC- x crossed DNA-Endonuclease. Auflösung der Holliday-Struktur -
- Wie erfolgt das Auflösen einer Holliday-Struktur? Welche Produkte können entstehen? - Isomerisierung - Spleißprodukte (Umverteilung der flankierenden Gene) - Patch-Produkte (keine Umverteilung)
- Wofür ist die Chi-Sequenz bei der Homologen Rekombination wichtig? - Inaktivierung von RecD - 3'-Strang wird nicht weiter abgebaut, 5'-Strang aber schon - crossing over-hotspot
- Welche Funktion hat RecA und was passiert in einer recA-Mutante bzw. was kann nicht erfolgen? - katalysiert den ATP-getriebenen DNA-Austausch bei der homologen Rekombination - Protein-DNA-Filament - recA. keine homologe Rekombination
- Was bedeutet kooperative Bindung und Polarität bei RecA? - kooperative Bindung: die Bindung eines DNA-Moleküls erleichtert die Bindung weiterer DNA-Moleküle - Polarität: RecA-DNA-Filament wächst nur in 5'-3'-Richtung
- Welche Folgen haben Mutationen in recBD für die Rekombination? - reduzierte Rekombination
- Enzymatische Funktion von RecC? - RecC vermittelt die Bindung des RecBCD-Komplexes an die DNA
- Welche Schritte erfolgen auf DNA-Ebene bei der homologen Rekombination in Bakterien? Zählen Sie auf. Welche Funktion haben dabei die Genprodukte RecA, RecBCD? Erklären Sie anhand der einzelnen Schritte die Funktion der Rec Genprodukte und beachten Sie die Vorgänge auf den komplementären DNA-Strängen einer DNA. 1. Parallele Anordnung der DNA Doppelstränge (RecA)2. Strangbrüche werden erzeugt (RecBCD)3. Stranginvasion (strand invasion)4. Entstehung von Heteroduplex DNA5. Ausbildung der Holliday Struktur (Holliday Junction = HJ)6. Wanderung des Verzweigungspunktes(branch migration)7. Auflösung (resolution) der HJ (Ruv)
- Was ist das LexA Regulon, wofür ist dieses Regulon wichtig? Das LexA-Regulon enthält diverse Gene, die (vermutlich) an der DNA-Reparatur beteiligt sind, u.a. RecA. Es dient zur Regulation der SOS-Reparatur. - LexA ist ein Repressor, der das LexA-Regulon reguliert. Wenn RecA DNA-Fragmente bindet, erhält es proteolytische Aktivität und baut LexA ab -> Expression
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- Nicht-Homologes End-Joining (NHEJ) in Bakterien – was ist das und was passiert dabei? - Mechanismus zur Reparatur von DSB -