12
Molgen Prokaryoten (Subject) / Mobile genetische Elemente (Lesson)
Advertisement
- Transposontypen und Unterscheidung - Poly A-Retrotansposons: keine terminale IR, ORF1 codiert für ein RNA-bindendes Protein, ORF2 für RT- und Endonuclease-Aktivität - LTR-Retrotransposons: codieren für Integrase und RT, sog. long terminal repeats (250-600 bp) - DNA-Transposons: Klasse II, IR-Elemente und Transposase-Gen - simple Transposons < 2000bp - composite Transposons (mit IS-Elementen, springt als Block) - complex Transposons: > 2000bp, enthalten auch bakterielle Gene und Resistenzen usw.
- 17. Gibt es für die Transposons Zielsequenzen? - teilweiser zufällig, teilweise an hotspots - AAAN20TTT als Zielsequenz
- 18. Nennen Sie die Eigenschaften von Transposons und ihre Größe - simple: 600-800 bp, maximal 2000 - Tn-Elemente: über 2000 bp - von IR-Elementen flankiert - können Mutationen hervorrufen und Resistenz- und Pathogenitätsgene übertragen
- 19. Welche mobilen DNA Elemente kenne Sie bei Bakterien? – zählen Sie auf. Was kann durch diese Elemente mit übertragen werden? - IS-Elemente - Transposons - Integrons - conjugative Transposons - Phagen - Plasmide - Übertragen werden können: Resistenzgene, Pathogenitätsinseln
- 20. Was ist ein konjugatives Transposon? Beschreiben Sie die Eigenschaften eines konjugativen Transposons (im Allgemeinen) und an welchen Ereignissen sind die Genprodukte des konjugativen Transposons beteiligt. - konjugative Transposons sind normalerweise ins Chromosom integriert - können ihren Transfer in eine Empfängerzelle durch Zell-Zell-Kontakte auslösen - die Genprodukte sind an der mating pair formation und dem konjugativen DNA-Metabolismus beteiligt.
- 21. Was ist eine Transposon-Shuttle-Mutagenese? Beschreiben Sie die Versuchsdurchführung und was Sie für eine Shuttle-Mutagenese benötigen. Was ist der Vorteil der Tn-Shuttle-Mutagenese im Vergleich zu einer klassischen Transposon-vermittelten Mutagenese? - Gentransfer in das bakterielle Chromosom mithilfe von Transposons - Zerstörung oder Modifizierung existierender Gene - nachgucken
- 22. Worin unterscheiden sich ein „composite“ Transposon, ein „simple“ Transposon und ein „conjugate“ Transposon? Erklären Sie die Eigenschaften dieser 3 Transposons. - composite: zusätzlich IS-Elemente an den Flanken - simple: nur IRs - konjugativ: kann sich durch Konjugation verbreiten, Gene an MPF und DNA-Metabolismus beteiligt
- 23. Was ist der Unterschied zwischen einer replikativen Transposition und konservativen Transposition? Erklären Sie. - konservative Transposition: "cut and paste"-Mechanismus, Excision durch Doppelstrangbruch und Insertion in Ziel-DNA - replikative Transposition. zunächst Erzeugung von Einzelstrangbrüchen, dann Strang-Transfer auf Ziel-DNA. Replikationsbeginn an der linken Lücke. nach Replikation Ligation -> Cointegrat mit zwei Transposon-Kopien
- Mobile DNA Elemente in Bakterien? - Transposons, konjugative Transposons, IS-Elemente, Integrons, Plasmide, PAIs, Bakteriophagen, Pathogenitätsinseln
- Eigenschaften der Transposons, IS Elemente, Integrons, Plasmide, PAIs, conjugative Transposons, Phages - Transposons: wechseln Posotion innerhalb des Genoms und können Mutationen verursachen, codieren oft Transposase - IS-Elemente: Insertionssequenzen mit gegenläufigen inverted repeats an beiden Enden und ORF. 800-1200 bp. Eigennützige DNA - Integron: können Gen-Kasetten einfangen und über ortsspezifische Rekombination aufnehmen. Oft Teil eines mobilen genetischen Elements (Transposon, Plasmid), horizontaler Gentransfer - Plasmid: ringförmige, extrachromosomale DNA. Kann aufgenommen und abgegeben werden
- Advertisement
- Transposons? Größe? - „springende DNA“, die sich auf der chromosomalen DNA und in Plasmiden bewegen kann. - > 800 BP - können Mutationen verursachen - von inverted repreats flankiert
- Unterscheidung der Transposons? - Poly A-Retrotansposons: keine terminale IR, ORF1 codiert für ein RNA-bindendes Protein, ORF2 für RT- und Endonuclease-Aktivität - LTR-Retrotransposons: codieren für Integrase und RT, sog. long terminal repeats (250-600 bp) - simple Transposons: codieren für Transposase, IR-Elemente