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Molekularbiologie (Subject) / Mikrobiologie 2 (Lesson)
- Aufgaben der RNA-Polymerase (5) - Promotor Erkennung - Entwinden der ds-DNA (Helicase Funktion) -> ssDNA - Kathalysierung der Phosphodiester Bindungen zwischen Ribonucleotid Triphosphaten - Erkennung von Terminationssignalen - Interaktion mit Transkriptionsfaktoren
- Aufbau der RNA-Polymerase - 2x alpha Untereinheiten (rpoA) -> Promotoren Erkennung, Interaktion mit Transkriptionsfaktoren, Enzyme assembly Beta und Beta`Untereinheiten (rpoB, rpoC) -> Kathalytisches Zentrum für RNA-Synthese - Omega- Untereineheit -> Funktion unklar (würde auch ohne funktionieren) = Core-Polymerase - Sigma Untereinheit (rpoD) -> weitere altnernative sigma-faktoren zur Anpassung (7 bei E.coli) an Umweltschwankungen -> Holoenzym
- Bakterielle Promotorelemente (3) = Charakteristische Basenfolgen oberhalb der zu transkribierenden Region 1. Pribnow Box (-10): stark konsveriert, Konsensus sequenz = TATAAT, immer AT-reich (öffnung des Doppelstrangs), zusammensetzung fungiert als wichtiger mechanismus zur regulation des Gens 2. -35 Region: wie die Pribnow box sequenzspezifisch -> wird mit hoher spezifität von der RNA-Polymerase erkannt, 3. UP-Element: AT basenreiche region oberhalt der -35 Box, nicht essentiell, nicht sequenzspezifisch, werden von alpha Untereinheit erkannt
- Komplexe der Transkription (3) sobald er der sigma faktor der Polymerase die Promotor Region erkannt hat, greift die Polymerase um den DNA strang = geschlossener Komplex die DNA wird an der -10 Region geöffnet -> ssDNA = offener Komplex "Stottern" der RNA - Polymerase (häufiges Abbrechen der Transkription nach wenigen Basen) = Ternary Komplex promotor Escape ( dazu muss sigma faktor abgelöst werden) Elongation bis zur Termination
- Genregulation auf Transkriptionaler Ebene. Angriffspunkte der negativen und positiven Regulation? negative Regulation greift am Operator -> TFs blockieren die RNA-Pol positive Regulation greift am Aktivator -> vielfältige Wirkweisen: z.B Unterstützung der Promotor Erkennung, Hilfe beim Escape -> Sequenzen an denen hochspezifisch Transkriptionsfaktoren binden
- 1. negative, induzierbare Kontrolle - Repressor bindet an Operator-Seuqenz und verhindert somit die Transkription, bis ein Substrat an den Repressor bindet und (auch chem. veränderung wie Phosphorilierung) dieser sich löst. -> inaktivierung des Repressors durch Induktor
- negative, reprimierbare Kontrolle Repressor so lange inaktiv bis Substrat (Konformationsändernde Substanz) bindet -> aktivierter Repressor blockiert den Promotor
- Positive, induzierbare Kontrolle Aktivator zunächst inaktiv -> Binden des Induktors aktiviert den Aktivator und ermöglicht positive Regulation
- Positive, reprimierbare Kontrolle Aktivator so lange aktiv bis der Co-Repressor Bindet -> inaktivierung durch Co-Repressor
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