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Molekularbiologie (Subject) / Mikrobiologie (Lesson)
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- Größe plasmid (bp): Größe chromosom : Plasmid:1kbp bis > 500 kbp Chromosom: 02 bis 10 Millionen Bp
- Nucleoid Chromosomenstrukuter in der Bakterien
- Minimale Genanzahl 473
- Verpackung der DNA? Welche Enzyme nötig? offener Kreis -> loops -> supercoiled loops Enzym: Topoisomerase. Typ 2 -> doppelsträngige Brüche (Gyrase)
- Unterschiede DNA pol 1/ pol 3 pol I -> nur eine subunit, besitzt 5`-3`exonuklease aktivität (Klenow fragment), ca. 20 Nukleotide pro sekunde, Prozessivität = 200 Pol III -> mehr als 10 subunits, nur 3`-5`exonuklease aktivität, bis zu 1.000 bp/s, Prozessivität von 500.000
- Welche untereinheit der DNA Pol III ist für die hohe prozessivität verantworlich? rinklemme (sliding clamp), gebildet durch beta untereinheiten
- MMR-Systhem? Methyl directed mismatch repair system. -> DAM methylierungsstellen = Erkennungssequenz für Methylierung neuer Strang weist noch keine Methylierung auf -> Hemimethylierung -> neuer (fehlerhafter) strang kann ausfindig gemacht werden
- Initioation of replication welche proteine von Nöten? wie wird die initiation reguliert? dnaA Proteine (=Initiator Protein) lagern sich am Oric an (essentiel in allen Bakterien) -> ermöglicht durch konformationsänderung das Binden weiterer Proteine : Helicase (dnaB), Helicaseladeer (dnaC), Primase (dnaD). Regulation durch viele Bindestestllen. z.b 11 DAM Methylierungsstellen am Oric. Bei Hemimethylierung der DAM- Stellen binden Inhibitor Proteine
- DNA Replikation -> Termination wie wird "Zusammenstoß" der Polymerasen verhindert? TER - sites. -> DNA Sequenz welche verhindert dass die Helicase weiter arbeiten kann. TER sites sind nicht symmetrisch -> wirkt nur in eine Richtung. während die eine Polymerase schon abgesprungen ist, synthetisiert die andere weiter.
- Chromosome Partitioning DNA synthese maschinerie bleibt standorttreu, während die DNA zum, bzw. vom ort der synthese transportiert wird. -> neusynthetisierte Chromosome müssen für die Teilung getrennt werden -> Cleaner proteins
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- Was wird zur Transkription neben der RNA - pol noch benötigt? - Doppelsträngige DNA als Template- aktivierte Ribonukleotide- Mg 2+, Mn2+ Ionen
- Unterschied zur DNA-Synthese Im gegensatz zur DNA-Synthese werden bei der RNA -Synthese alle schritte von einem Molekül durchgeführt (RNA -Pol) : Erkennung, Aufwinden, Elongation, Termination
- Unterschied der RNA- Synthese in Eukaryothen und Prokaryothen? In Prokaryonten werden alle Arten von RNA (mRNA, rRNA, tRNA, sRNA) bis auf die Primase, die auch eine RNA enthält, von nur einer sorte RNA-Pol hergestellt. Die RNA-Polymerase ist hoch konserviert
- Pribnow Box durch welches molekül erkannt? -10 Region. TA-reich. reguliert die initiation. Konsensussequenz = TATAAT durch sigma-Faktor erkannt
- UP - Element sequenz, welche den promotr ankündigt. -> von alpha untereinheiten erkannt !nicht sequenzsspezifisch, fakultativ
- Warum ist die RNA-Pol langsamer als die DNA-Polymerase durch komplexes Faltung der RNA bedingt