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Molekularbiologie (Subject) / Fragen RNA and then (Lesson)

RNA and then

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  • Which kind of processing steps can eukaryotic RNA encounter? Auf welche Verarbeitungsschritte kann eukaryotische RNA treffen? Cleaving, splicing, polyAdenylation, Capping, Editing  
  • Is the half-life of all RNAs similar? no
  • What effects RNA stability? Was beeinflusst die RNA-Stabilität? 5' and 3' structures (e.g. cap) hairpins, splicing 5 'und 3' Strukturen (z. B. Kappe) Haarnadeln, Spleißen  
  • Explain bacterial/eukaryotic RNA degradation? Erklären bakteriellen / eukaryotischen RNA-Abbau? Die RNA-Interferenz (RNA-Silencing) - natürlicher Mechanismus in den Zellen von Lebewesen mit einem Zellkern (Eukaryoten), welcher der zielgerichteten Abschaltung von Genen dient. Die RNA-Interferenz beruht auf einer Wechselwirkung kurzer Stücke von Ribonukleinsäure (RNA) mit der Erbinformation-übertragenden mRNA unter Beteiligung mehrerer Enzymkomplexe. Als Folge wird die mRNA in mehrere Bruchstücke gespalten und die zu übertragende Information wird zerstört oder eine Translation in ein Protein verhindert. 
  • Which nucleotide is used by EF-TU/Ts? GTP  
  • Which trick to tranlsation factors often use to access the ribosome interface? Welchen Trick nutzen Translationsfaktoren häufig, um auf die Ribosomenschnittstelle zuzugreifen? They can mimic tRNAs Sie können tRNAs nachahmen  
  • Apart from a start codon which other sequence do you need in bacteria to start translation? Abgesehen von einem Startcodon welche andere Sequenz brauchen Sie in Bakterien, um mit der Translation zu beginnen? The Shine Dalgarno sequence (be prepared to explain how it works as well) Die Shine Dalgarno-Sequenz. Sequenz der mRNA, Teil der ribosomalen Bindungsstelle die von den Ribosomen erkannt wird, und damit den Startpunkt der Translation markiert. 
  • What is the Kozak sequence? The Sequence A/GXXAUGG which is helping in recognizing the "right" AUG in eukaryotes Die Sequenz A / GXXAUGG, die bei der Erkennung der "richtigen" AUG in Eukaryoten hilft
  • Is stop codon recognition sloppy? Ist Stop-Codon Erkennung schlampig? No it ids highly accurate Nein, es ist sehr genau  
  • what is tmRNA used for, where is it used and explain how it is used? bacterial quality control Um dem zu begegnen, erfüllt die tmRNA folgende wichtige Funktionen: -Sie befreit feststeckende Ribosomen von der mRNA und fügt diese wieder dem Translationspool zu. -Sie markiert die bei der Translation entstandenen unvollständigen Peptidketten für den Abbau.  
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  • Explain the 21st amino acid and its protein incorporation? Erklären Sie die 21. Aminosäure und ihre Proteinaufnahme? Selenocytstein • Selenocystein-tRNA wird erzeugt, indem tRNASec mit Serin beladen wird und dann das Serin in Selenocystein umgewandelt wird. tRNASec hat ein Anticodon, das zu UGA passt• In E. coli wird die Selenocystein-Insertionssequenz (SECIS) 3 'des UGAs gefunden, die rekodiert wird  
  • Is Pyrrolysine a proteinogenic amino acid? Ja
  • What is the magic spot? (p)ppGpp which is synthesised through RelA (p) ppGpp, das durch RelA synthetisiert wird  
  • Give an example for the less common 5' UTR regulation in eukaryotes? ferritin : be prepared to explain the mechanism  
  • How is splicing coupled to NMD? Ein Proteinkomplex der durch das Spliceosom auf der fertigen mRNA abgesetzt wird (der Exon-Junction-Complex, EJC) ermöglicht einen effektiven Export aus dem Zellkern und übermittelt dabei zusätzlich eine Information, die eine spätere Qualitätskontrolle der RNA während der Translation ermöglicht (Nonsense-mediated mRNA decay, [NMD]).