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Molekularbiologie (Subject) / Fragen Small RNA (Lesson)
Small RNA
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- What can Dicer (and Dicer Like) do to double stranded RNA? Was kann Dicer (und Dicer Like) mit doppelsträngiger RNA tun? It cleaves it into short pieces. Es spaltet es in kurze Stücke.
- How can plants defend themselves against plant viruses? siRNA -> silencing AGO: Erkennen den Virus und setzen Abwehrmechnismus in Gang. (Agronautenproteine) Doppelsträngige RNS wird von bestimmten Enzymen, den Dicers erkannt und in 21 bis 24 Basenpaare lange Stücke zerschnitten, in (si)RNS. RISC verhindert dann deren Translation oder zerschneidet sie, ein Mechanismus, der posttranskriptionelle Gendämmung (posttranscriptional gene silencing) genannt wird.
- What is remarkable about siRNA duplexes? They can spread between cells. Sie können sich zwischen den Zellen ausbreiten.
- What is Co-suppression? When a construct is brought into a genome in normal sense orientation and both the introduced gene and the endogenous gene are silenced 7/29 Wenn ein Konstrukt in normalem Sinne in ein Genom gebracht wird, werden sowohl das eingeführte Gen als auch das endogene Gen 7/29 zum Schweigen gebracht
- You want to suppress a gene in C. elegans, which RNA would you introduce a) sense -----> b) antisense <-------- c) double stranded <-====-> double stranded
- Can small RNAs effect DNA? Können kleine RNAs die DNA beeinflussen? Yes siRNAs for example can target regions for Cytosine methylation or histone modifications. Ja, siRNAs können zum Beispiel auf Regionen für Cytosin-Methylierung oder Histon-Modifikationen zielen.
- How many RNA polymerase classes would you find the genome of an angiosperm plant? 5
- What is the role of RNA Pol IV in plants? Production of siRNA
- Describe the core components of how miRNA are processed in animals? Beschreiben Sie die Kernkomponenten, wie miRNA in Tieren verarbeitet werden? See slide: RNA Pol makes pri-mRNA which is cleaved into pre-miRNA (Drosha), exported from the nucleus (Exportin), there pre-miRNA is cleaved by Dicer and finally RISC complex is formed (what is not shown there is strand selection... just fro your info) Siehe Folie: RNA Pol erzeugt Pri-mRNA, die in pre-miRNA (Drosha) gespalten, aus dem Nukleus exportiert wird (Exprestin), dort wird prä-miRNA durch Dicer gespalten und schließlich RISC-Komplex gebildet (was dort nicht gezeigt ist, ist Strang Auswahl ... nur für Ihre Info)
- What is a *-strand? The strand of a miRNA that is usually (or probably better: more often) degraded. Der Strang einer miRNA, der normalerweise (oder wahrscheinlich besser: öfter) abgebaut wird.
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- Which gene class is often targeted by conserved miRNAs? Transcription factors