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Epigenetik und Chromatin (Fach) / VL3 (Lektion)
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- Acylierung mit: - Propionyl - Butinyl - Crotonyl - Saccinyl - Malonyl Enzyme: selbe wie bei Acetylierung, mit speziellen Co-Faktoren zB. Eraser: NAD+- dependant sirtuins Zn+- dependant HDACs
- Klassen von HDACs Klasse 1: Rpd3-like Klasse 2: HDa1-like Klasse 3: Sir2-like Klasse 4: HDAC 11
- Sir2 - Teil des Sir2/3/4- Heterochromatin- Komplexes von S.c. - hat in Hefe Einfluss auf Alterung - menschl. Homologe Sirtuine
- Funktion von Deacetylasen - werden an Gen rekrutiert und entfernen Acetylierung → Repressorfunktion
- Klasse 1: Rpd3L vs. Rpd3S Rpd3L: Deacetylierung an Promotoren - verhindert Transkriptionsinitiation Rpd3S: Deacetylierung kodierende Region kleiner: verhindert TRanskription im Open Reading frame
- HDAC- Inhibitoren zB. Tricostatin A SAHA: klinisch wichtig, zB. bei Krebs Valproic und Butinyl acid
- Welchen Zusammenhang gibt es zwischen Methylierung durch Set und Deacetylierung durch Rpd? Set2 methyliert K36 Lysin und fördert dadurch Transkription rpd3S erkennt K36 und bindet, wird an transkribierenden Bereich rekrutiert und dort findet Histon-Deacetylierung statt. - dadurch wird Gen wieder ausgeschalten → Feedback-Mechanismus - inaktiviert Chromatin nach Transkription wieder
- Was ist Histon-Methylierung? - Hs der NH3+- Gruppe können alle durch Methyl ersetzt werden → Mono-, Di- oder Tri-Methylierung
- Was sind Unterschiede von Histon- Acetylierung und Methylierung? Methylierung: 1) Mono-, Do-, Tri-Methylierung möglich → graduell 2) Positive Ladung bleibt bei Methylierung erhalten: nicht erklärbar durch Ladungsänderung
- 2 Familien von Methyltransferasen 1) SET (supressor of variegation) 2) Dot1 (Disruption of telomeric silencing)
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- Auf was kann man aufgrund der Methylierungsmuster schließen? Aktivität