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Virologie (Fach) / Coronaviridae (Lektion)

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  • Taxonomie; SARS + MERS Coronaviridae --> Coronavirinae --> Alpha, Beta, Gamma, Delta Alpha + Beta = Fledertiere Gamma + Delta = Vögel SARS --> Betacoronavirus MERS --> Betacoronavirus
  • Merkmale Umhüllt  pos. ssRNA (~ 30.000 nt) ca. 100 nm
  • Strukturproteine S -> Spike E -> Envelope M -> Membrane N -> Nucleocapsid
  • Nichtstrukturproteine Nsp3 -> PL2pro: Protease (Papain-like Protease spaltet zwischen nsp1 - nsp4, Deubiquitinylierungsfunktion, blockiert IFN-Induktion) Nsp5 -> 3CLpro: Protease ORF6/Protein 6 -> Blockiert ISGF3-Komplex (Interferon-Signaling) Nsp7 -> ssRBP: ssRNA binding protein Nsp12 -> RDRP: RNA abh. RNA Polymerase Nsp13 -> Hel: Helicase Nsp14 -> ExoN: 3'->5' Exonuclease (proof reading!) Nsp15 -> NendoU: Uridylate.spez. Nsp16 -> 2'OMT: Ribose-2'-O-methyltransferase (Nsp 1 - 16)
  • Protease vermittelter SARS-CoV Eintritt - Folgen? Protease z.B. TMPRSS2 vermittelt direkte Virus-Zell Fusion (cathepsin unabhängig) Protease z.B. TMPRSS2 vermittelt direkte Zell-Zell FUsion --> Synzytien, Verbreitung von Zelle zu zelle möglich
  • Replikationsort DMV (double membrane vesicles vom ER) (Genauer Mechanismus unklar; nsp4, nsp6) DMV schützt vor Erkennung durch zelluläre RNA Helicasen RIG-I und Mda5 (pattern recognition receptors)
  • Slippery Sequenz UUUAAAC unmittelbar vor dem Translationsstoppcodon des ORF 1a --> RNA Sekundärstruktur (Pseudoknoten) -->-->Leserahmenverschiebung in -1 Position "Überlesen" des Stoppcodons --> Orf 1a/b
  • Subgenomische mRNAs Ersten ~ 70 bp aller sgRNAs sind identisch Transkriptionsgradient Diskontinuierliche Transkription während der (-)-Strang Synthese
  • Budding und Exozytose Budding am ERGIC Exozytose daher via Vesikel
  • Rezeptoren SARS-CoV --> ACE2 TGEV (Transmissible gastroenteritis coronavirus), CCoV (Canine coronavirus) --> CD13 MERS --> DPP4
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