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Molekularbiologie (Fach) / Fragen Folding (Lektion)
Folding
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- Explain roughly how Hsp70 chaperones work? These prevent hydrophobic patches to aggregate Diese verhindern, dass hydrophobe Flecken aggregieren
- Explain how GroEL/ES chaperones work? GroEL/GroEs faltet andere Proteine aktiv unter ATP-Verbrauch. Die Bindung des ungefalteten Proteins erfolgt im Zentrum des Komplexes. GroES beeinflusst die Faltungsaktivität von GroEL, indem es die ATPase Aktivität reguliert. Ohne gebundenes Substratprotein wird diese ATPase durch GroEL inhibiert.
- What is PDI? Potein disulfide oixidase, it both oxidises and swaps disulfide bonds. Protein Disulfid Oxidase oxidiert und tauscht Disulfidbindungen
- In which diseases do prions seem to play a role (at least two)? Bei welchen Krankheiten scheinen Prionen eine Rolle zu spielen (mindestens zwei)? BSE, Scrapie, nvCJD, GSS ....
- Are prions only occuring in higher organisms? Prionen kommen nur in höheren Organismen vor? No yeast also has prions Nein, Hefe hat auch Prionen
- Can you cure certain prions and if yes how? Kannst du bestimmte Prionen heilen und wenn ja wie? Certain yeast prions can be cured by chaperons Bestimmte Hefe-Prionen können durch Chaperone geheilt werden
- Explain what inteins are and their potential application in biotechnology? Proteinregionen, die sich autokatalytisch aus dem Protein "spleißen". Sie können in der chemischen Semisynthese verwendet werden
- Name the three main types of lipd modification? Acylation, Prenylation, GPI anchors
- What is interesting about hedgehog? Es ist mit Inteinen verwandt und es ist mit Cholesterin modifiziert
- If you add carbohydrates to proteins how does this often effect these? Sie können löslicher und geräumiger werden
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- What can ROS and NOS lead to? modified AA, give at least on example each
- Stellen Sie den UBQ-Weg dar? Der Proteinabbau (Proteolyse) wird mit der Aktivierung von Ubiquitin durch ein ATP-verbrauchendes Enzym E1 vorbereitet. Hierbei erhält Ubiquitin am Carboxylterminus eine reaktive Thiolester-Gruppe. In dieser Form wird es auch auf ein kleines Carrier-Protein E2 übertragen. Oft benötigt E2 noch eine Ubiquitin-Ligase E3, um Ubiquitin erfolgreich an die Aminogruppe der Peptidkette des abzubauenden Proteins zu koppeln. Ubiquitin besitzt auch einen Lysin-Rest und kann somit selbst ubiquitiniert werden.
- Wie viele Isoformen haben Sie beim UBQ-Weg von den entsprechenden Enzymen? Often one E1, several E2 and very many E3
- If you attach polyubq via K48 what does it lead to? degradation in the proteasome
- What does the proteasome do? degradieren (sicher!) ubq-markierte Proteine
- Explain one unfolded protein response (ATF6) in eukaryotes? ATF6 ist ein stressregulierter Transmembran-Transkriptionsfaktor des Endoplasmatischen Retikulums (ER), der die Transkription von ER-Molekülen aktiviert. Die Ansammlung fehlgefalteter Proteine im Endoplasmatischen Retikulum führt zur proteolytischen Spaltung von ATF6. Der zytosolische Teil von ATF6 wird sich zum Kern bewegen und als ein Transkriptionsfaktor wirken, um die Transkription von ER-Chaperonen zu bewirken.