1. Primäre EST: beschreibt die Entstehung von Mitochondrien und einfachen, primären Plastiden. In diesem Fall hat eine eukaryotische Zelle eine prokaryotische Zelle (Mitochondrien: alpha-Proteobakterium, Chloroplasten: Cyanobakterium) durch Endophagozytose aufgenommen. Die so entstandenen Kompartimente besitzen demnach eine prokaryotische Innen- und eine eukaryotische Außenmembran.2. Sekundäre EST: beschreibt die Entstehung von komplexen Plastiden einiger Algen. Komplexe Plastide sind dadurch entstanden, dass eine eukaryotische Zelle einen weiteren eukaryotischen Einzeller mit Plastiden endophagozytiert hat. Die dadurch entstandenen komplexen Plastiden haben dadurch mehr als zwei umgebende Membrane.Als Nucleomorph wird der Rest des endozytierten Zellkerns bezeichnet.