rRNA-gerichtete Oligonukleotidsonden (FISH = Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung)

• In-situ-Hybridisierung (ISH) = molekularbiologische Nachweis von Nukleinsäuren _{(RNA, DNA)} → in Geweben, einzelnen Zellen oder auf Metaphase-Chromosomen.
• Dabei wird eine künstlich hergestellte Sonde probe aus einer Nukleinsäure eingesetzt, die über Basenpaarungen an die nachzuweisende Nukleinsäure bindet (Hybridisierung).⇒ Sonden-DNA + Ziel-DNA werden zu Einzelsträngen aufgeschmolzen. _{= Paarung von komplementären Basen Sonde-DNA- & Ziel-DNA-Einzelsträngen.}

• Bei der Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) wird die Sonde mit Hilfe eines fluoreszierenden Farbstoffes nachgewiesen⇒ ermöglicht den gleichzeitigen Nachweis mehrerer Strukturen durch den Einsatz verschiedener Fluoreszenzfarbstoffe, z. B. Nachweis eines Chromosoms mit zwei darauf liegenden Genen

• Phylogenetische _{Stammesgeschichte} Farbstoffe = markierte Sonde = z. B. Oligonukleotid + Cy3 (Fluoreszenz-Farbstoff Cyanin), die in ihrer Basensequenz zu konservierten Sequenzen der 16S-rRNA (Prokaryoten) komplementär bindet. ⇒ leuchten unter Fluoreszenz-Mikroskop