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Grundlagen Eukaryotischer Plasmide, Vererbung,... Quelle Skript meint das von meinem Prof zur Verfügung gestelle Skript.

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  • Inkompatibilität - Wechselseitiger Ausschluss von Plasmiden mit gleichem F-Faktor. - Dieser trägt Gene für die Replikationskontrolle und die Replikation sowie Entstehung weiterer F-Faktoren innerhalb der Zelle verhindert. ...
  • Curing -Verlust von Plasmiden aus Bakterienzelle. -artifiziell durch den Einsatz von Chemikalien wie z.B. Ethidiumbromid,.. herbeigeführt. -Dies stört die Replikation der Plasmid DNA--> Nachweis durch verlorene ...
  • Partitionierug -Stellt sicher das jede Tochterzelle ein Plasmid erhält. -ParM, ParC, ParR -Parc-ParM Komplex, bildet nucleation site--> Bildung von ParM welches Aktin ähnlich ist. -Plasmide wandern zu den Zellpolen. ...
  • Plasmid ColE1 -INC codiert für RNA I -Regulation über RNA I--> Ohne ergibt sich ein RNA-DNA Hybrid am Ori--> Cleavage RNA II--> Primer -RNA I ist eine ctRNA (Kissing Complex), welche sich auf RNA II setzt und somit ...
  • ColE1 RNA I/II Hybrid -Sekundäre RNA-Loop Struktur nötig um RNA/DNA Hybrid zu stabilisieren. -RNaseH stellt 3´OH her --> Primer --> für DNA Synthese bei Replikation. -RNA I/II hybridisieren 5´terminal, zerstören Loops! ...
  • IncFII Plasmid R1 Kontrolle Kontrolle Teil: I -RepA: Initiation der Replikation. -PcopB für RepA und CopB --> bicistronische mRNA -PRepA nur RNA für RepA -CopB: reprimiert Promotor PRepA --> Replikation bis genug CopB vorhanden! -Burst synthese ...
  • IncFII Plasmid Kontrolle Teil:2 -antisense /ctRNA CopA, welche Promotor in entgegengesetzter Richtung hat!!!  -RepA, welches auch über PCopB als bicistronische mRNA gebildet wird, hybridisiert mit ctRNA CopA! -RNAse III schneidet, ...
  • Plasmid Collb-P9 Teil:1 -Antisense RNA kontrolliert Kopienzahl -RepZ wirkt positiv auf oriV! translationale Kopplung RepZ+RepY--> leaderpeptid -RNA: RepY Bereich, INC bildet downstream eine Sekunder Loop Struktur aus. Upstream ...
  • Handcuffing / coupling Modell -Protein RepA lagert sich an Iteron Sequenz an--> Dimerisierung der Plasmide--> Verhindert Replikation!
  • Replikation: Theta -theta Intermediat: bidirektionale Replikation mit zwei Replikationsgabeln in entgegengesetzte Richtung. -Rep bindet an OriV--> Aufschmelzen des Doppelstrangs -Primase: bildet Primer, Helikase: entwindet ...
  • Replikation: Rolling circle -Rep Protein erkennt Palindrom am ds ORi, -Basenpaarung der Inverted repeat Regionen (IR) -DNA Pol III an 3´OH, nutzt äußeren Strang als Matrix, synthetisiert Einzelstrang DNA--> Nick trennt Kompel ...
  • Was sind Plasmide? -Plasmide kodieren für nicht essentielle Gene--> oftmals Resistezen oder Toxzizität -Verschaffen einen selektive Vorteil -Codieren für Typ III Sekretionssystem -Quelle: Skript