Rasterelektronenmikroskop: Objekt ist mit Metall beschichtet und wird mit Elektronen beschossen. Aus den reflektierten Elektronen wird ein Bild erstellt.

Transmissionselektronenmikroskop: Elektronen gehen durch und werden unter dem Objekt gemessen. Auf dem entstehenden Bild sind Bereiche größerer Dichte dunkler und die Bereiche geringerer Dichte heller. Deshalb wird das Negativ dargestellt, damit das gewohnte Bild zu sehen ist.