Nach der Verdoppelung des genetischen Materials legt sich eine Chromatide über die andere. An der „Crossing-over-Stelle“ brechen die Chromosomen auseinander und tauschen Abschnitte aus. Crossing over tritt während der Prophase I der Meiose auf.

Dadurch wird genetische Vielfalt erhöht, weil nicht immer alle Gene auf einem Chromosom gemeinsam vererbt werden.